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Os Programas a serem desenvolvidos na PCH Irara são: Monitoramento Limnológico e de Qualidade da água, macrófitas e mexilhão dourado; Monitoramento da Ictiofauna e Resgate de peixes na parada de manutenção das turbinas e piracema; Resgate de Germoplasma e Recomposição da APP; Monitoramento da Avifauna, Herpetofauna e Mastofauna; Monitoramento e Controle dos Processos Erosivos; Contingenciamento de Segurança e Informação Ambiental; Programa de Educação Ambiental; Recuperação de Áreas Degradadas; PACUERA; Assessoria técnica e acompanhamento da manutenção da Faixa de Servidão da LT.